لا يتم استخدام الآلاف من اختبارات فيروس كورونا في مختبرات الولايات المتحدة

أدى عدم وجود استراتيجية وطنية إلى إحباط جهود المختبرات الأكاديمية التي خضعت لجهود ضخمة لإعادة تجهيزها لاختبار COVID-19.

بينما تكافح الولايات المتحدة لاختبار الأشخاص لـ COVID-19 ، لا تعمل المختبرات الأكاديمية الجاهزة والقادرة على إجراء التشخيصات بكامل طاقتها.

وجد تحقيق في الطبيعة للعديد من المعامل الجامعية المعتمدة لاختبار الفيروس أنه تم تعطيلها بسبب عقبات تنظيمية ولوجستية وإدارية ، وإعاقة نظام الرعاية الصحية الأمريكي المجزأ. على الرغم من تراكم الاختبارات المتراكمة للمستشفيات في كاليفورنيا ، على سبيل المثال ، كانت العيادات ترفض عروض الاختبار من المعامل الأكاديمية المعتمدة لأنها لم تستخدم برامج سجلات صحية متوافقة ، أو لم يكن لديها عقود حالية مع المستشفى. يحذر الباحثون من أنه إذا بقيت مثل هذه العقبات ، فإن المعامل التي تحاول الانضمام إلى جهود مكافحة فيروس كورونا قد ينتهي بها الأمر بتدوير عجلاتها. تعد الولايات المتحدة الآن المركز العالمي للوباء ، حيث يوجد أكثر من 430 ألف حالة إصابة مؤكدة بـ COVID-19 ، بما في ذلك حوالي 15000 حالة وفاة.

يقول ستايسي غابرييل ، عالِم الوراثة البشرية في معهد برود التابع لمعهد ماساتشوستس للتكنولوجيا وهارفارد في كامبريدج ، ماساتشوستس ، حيث تمت الموافقة على مرافق الاختبار في مارس: "تبلغ طاقتنا 2000 اختبار يوميًا". "لكننا لا نفعل الكثير. كان يوم أمس حوالي 1000. ما الذي يعيقنا؟ هذا هو السؤال.

أنفقت The Broad والعديد من المختبرات الأمريكية الرائدة الأخرى آلاف الدولارات لتوجيه منشآتها - والتي تركز عادةً على مواضيع من هندسة الجينوم إلى أبحاث الخلايا الجذعية - لاختبار الأشخاص بحثًا عن فيروس كورونا ، باستخدام التقنية الأساسية PCR. لقد اجتازوا اللوائح الفيدرالية المعقدة وقاموا بتعديل بروتوكولات البيولوجيا الجزيئية الخاصة بهم. لكن على الرغم من ذلك ، يقول البعض إنهم يعملون بنصف طاقتهم أو أقل بسبب نقص الإمدادات أو لأن المستشفيات لن ترسل لهم عينات. يقول ديفيد برايد ، أخصائي الأمراض المعدية في جامعة كاليفورنيا ، سان دييغو ، الذي يساعد في قيادة عملية الاختبار: "يمكننا إعطاء النتائج في غضون 12 ساعة - 24 على الأكثر". لكنه وجد أن العديد من المستشفيات لا تزال تلتزم بشركات التشخيص التي اعتادت عليها - على الرغم من التقارير الواردة من ثلاثة إلى سبعة أيام بسبب الطلب.

الحواجز مقلقة لأنه يجب اختبار المزيد من الناس لوقف انتشار الفيروس التاجي. في مرافق المعيشة المشتركة ، على سبيل المثال ، يحتاج المسؤولون إلى معرفة ما إذا كان بإمكان السكان أو الموظفين إطلاق الفيروسات. ويخشى العاملون في مجال الرعاية الصحية من نقص الاختبارات لأنفسهم ، خوفًا من إمكانية نقل العدوى إلى الأشخاص المعرضين للخطر. يقول زيني كورتيز ، رئيس اتحاد الممرضات الوطني ، وهو اتحاد يضم 150 ألف عضو ومقره في سيلفر سبرينج بولاية ماريلاند: "ترفض العديد من المستشفيات أو تؤخر اختبار الممرضات الذين تعرضوا للفحص أو حتى تظهر عليهم الأعراض".

يقول العلماء إن القيادة الفيدرالية ضرورية لتنظيم الاختبارات الأمريكية ، لتقليل الحواجز البيروقراطية واللوجستية. كما أنهم ينضمون أيضًا عبر الإنترنت لمشاركة النصائح حتى تتمكن المعامل حول العالم من مواكبة التطورات بسرعة. يقول فيودور أورنوف ، المدير العلمي بمعهد الجينوميات المبتكرة في جامعة كاليفورنيا ، بيركلي ، الذي أطلق اختبار العملية في 30 مارس ، بعد أسابيع من التحديات. "حياتي أستيقظ في الثالثة صباحًا ، وأفكر في 24 شيئًا سيحدث خطأً اليوم."

خلقوا كابوسا

بدأت منظمة الصحة العالمية (WHO) في تحذير الحكومات للاستعداد لـ COVID-19 في يناير. كما قامت الوكالة بفحص وتوزيع اختبار PCR الألماني المطور للفيروس. ولكن بدلاً من استخدام هذا الاختبار ، طورت المراكز الأمريكية لمكافحة الأمراض والوقاية منها (CDC) اختبارًا خاصًا بها. بالنسبة لمعظم شهر فبراير ، كان هذا هو الاختبار الوحيد المسموح به في الولايات المتحدة.

مع الكشف في أواخر فبراير عن نقص المعروض من اختبارات مراكز السيطرة على الأمراض والوقاية منها ، سمحت إدارة الغذاء والدواء الأمريكية (FDA) ، التي تنظم استخدام الاختبارات التشخيصية الجديدة ، للمختبرات الأكاديمية ببدء اختبار فيروس كورونا. لكن هذه المعامل تتطلب شهادة تعديلات تحسين المختبرات السريرية (CLIA) ، والتي تبين أنها تلبي معايير الجودة. في يوم إعلان إدارة الغذاء والدواء (FDA) ، 29 فبراير ، بدأ قسم علم الفيروسات بجامعة واشنطن في سياتل حيز التنفيذ. كمعمل تشخيصي يخدم المستشفيات التابعة للجامعة ، كان لديه الشبكة والمعرفة وشهادة CLIA اللازمة للبدء على الفور.

بينما سارعت أقسام البيولوجيا الجزيئية الرائدة الأخرى للانضمام إلى هذا الجهد ، ثبت أن الحصول على الشهادة كان مرهقًا ، لذلك وجد العديد من الشركاء في العيادات المعتمدة من CLIA القريبة. يقول أورنوف: "كان هذا عملاً غير تافه". أدرك معهده ، بقيادة جينيفر دودنا ، المكتشف المشارك لأداة تعديل الجينات CRISPR ، أنه يمكن أن يدخل اللعبة من خلال الشراكة مع المركز الصحي للطلاب بالجامعة. اتخذ الباحثون ترتيبات مماثلة في معهد برود وجامعة بوسطن في ماساتشوستس وتشان زوكربيرج بيوهوب في سان فرانسيسكو ، كاليفورنيا.

كانت الخطوة الأخرى - وهي الخطوة الأفضل استعدادًا للعلماء الرائدين لمعالجتها - هي إجراء الاختبار الأكثر موثوقية لاستخدامه. قرر الكثير ضد نسخة CDC. يقول أورنوف: "لا أريد أن أكون مهينًا ، لكن الأشخاص الذين صنعوا مجموعة CDC فشلوا ببساطة في البيولوجيا الجزيئية - لقد خلقوا كابوسًا". لقد فكر في استخدام البروتوكول الموصى به من منظمة الصحة العالمية ، لكنه قلق بشأن نفاد المكونات الأساسية ، لأن المعامل في جميع أنحاء العالم تستخدم هذا الاختبار. من اليسار واليمين ، كما يقول ، كان الباحثون يتحدثون عن النقص. خضع أورنوف لاختبار طورته شركة الطب الحيوي Thermo Fisher Scientific ، ومقرها الرئيسي في والثام ، ماساتشوستس ، ويرجع ذلك أساسًا إلى أن المسؤول العلمي بالشركة أكد أنها ستبقي المعهد في الإمدادات. (يدافع المتحدث باسم مركز السيطرة على الأمراض عن جودة اختبارات الوكالة وإطلاقها ، قائلاً إن الوكالة طورت سريعًا اختبارًا لمراقبة الصحة العامة. وتضيف: "شجع مركز السيطرة على الأمراض أيضًا شركائنا الحكوميين على العمل مع القطاع الخاص لتطوير التشخيص اختبارات للاستخدام التجاري. ").

في كلية الطب بجامعة بوسطن ، اختار عالم أحياء الخلايا الجذعية جورج مورفي استخدام بروتوكول منظمة الصحة العالمية ، لكنه طلب من الباحثين في مختبره العثور على مكونات بديلة في حالة حدوث نقص. يقول: "هناك شيء ينفد كل يوم ، لذلك نحن دائمًا نجري التغييرات ونتحقق من صحتها". يستخدمون منصة الرسائل الفورية Slack لمناقشة هذه التغييرات مع أكثر من 600 باحث يحاولون تكثيف الاختبارات حول العالم.

لقد كان الأمر برمته ملحمة

بدأت موجة جديدة من التحديات عندما وصلت المعامل إلى المستشفيات التي تحتاج إلى اختبارات. يقول أورنوف: "إن عمل الطب الأمريكي وطريقة تنظيمه غير مستعدين بشكل مدهش لذلك". تتمثل إحدى المشكلات في أن المستشفيات الأمريكية تستخدم مجموعة من المنصات البرمجية للسجلات الصحية الإلكترونية. ويضيف برايد أن العديد من الدول لديها أيضًا إجراءات إدارية صارمة لإنشاء حسابات مع المختبرات وتبادل العينات والتعامل مع الفواتير. لهذا السبب ، اختارت العديد من المستشفيات الاستمرار في المعامل التجارية التي يعملون معها بالفعل ، كما يقول الباحثون.

في ولاية كاليفورنيا ، الأرقام صارخة: في أواخر مارس ، أبلغت وزارة الصحة بالولاية عن وجود ما يقرب من 57000 اختبار. ومع ذلك ، يقول أورنوف ، رفضت المستشفيات عرضًا لإجراء اختبارات مجانية من مركزه ، بتمويل من المنظمات الخيرية. يقول أورنوف: "لقد ظهرت في سفينة سحرية ، مع 20000 مجموعة مجانية و CLIA وكل شيء ، والمستشفيات الكبرى تقول:" ابتعد ، لا يمكننا التواصل معك ".

في رسالة بريد إلكتروني إلى Nature ، قالت إيما دوغاس ، مسؤولة العلاقات الإعلامية في نظام مستشفى سوتر الصحي في شمال كاليفورنيا: "استكشف سوتر تحليل اختبار COVID-19 مع موفر أكاديمي واحد على الأقل. لتحقيق النجاح ، يلزم وجود واجهة إلكترونية بين مزود المختبر و Sutter Health. " يضيف دوغاس أن سوتر لا تتوقع شراكة مع المعامل الأكاديمية في المستقبل ، وأنها تعمل على توسيع قدرات الاختبار الداخلية لديها.

عاقدة العزم على القيام بشيء مفيد من خلال الاختبارات المجانية ، تواصل فريق بيركلي مع مسؤولي الصحة في المدينة والمنظمة غير الربحية LifeLong Medical Care ، والتي توفر ، من بين خدمات أخرى ، الرعاية للأشخاص الذين ليس لديهم منازل دائمة أو تأمين طبي في بيركلي والمدن المحيطة. طلب مسؤولو المدينة من الفريق اختبار رجال الإطفاء ، وفي هذا الأسبوع ، أرسلت LifeLong عيناتها الأولى من الأفراد المشردين إلى المختبر. لا يتوافق برنامج LifeLong مع نظام بيركلي ، لذا يجب إدخال المعلومات يدويًا في الوقت الحالي ، كما يقول كبير المسؤولين الطبيين مايكل ستايسي. ويضيف: "إنه ليس مثاليًا ، لكننا نتحلى بالمرونة لأننا نريد اختبار الأشخاص الآن".

كانت المرونة أيضًا عنصرًا أساسيًا في عملية مورفي في جامعة بوسطن التابعة لمركز بوسطن الطبي. بعد حصول المختبر على التفويض التنظيمي ، كتب طالب دراسات عليا يدرس المعلوماتية الحيوية نصًا حاسوبيًا من شأنه أن يسمح لنتائج الاختبار بالتغذية مباشرة إلى نظام السجل الصحي الإلكتروني للمركز الطبي. فقط مع وجود ذلك في مكانه ، يمكن للمستشفى إرسال عينات المختبر والاستماع إلى النتائج. يقول مورفي: "قال المستشفى ، في العادة ، إن هذا سيستغرق ستة أشهر". شارك فريقه الكود الذي جعل هذا ممكنًا على المستودع عبر الإنترنت GitHub ، على أمل أن تتمكن المعامل الأكاديمية الأخرى من الاستفادة منه. يقول مورفي: "كان هذا الأمر برمته رحلة ملحمية.

تحرز المجموعات الأخرى تقدمًا ، ولكن فقط مع شركاء يرغبون في التحلي بالمرونة. يقول غابرييل: "لقد استغرقت حوالي 2000 مكالمة هاتفية والعديد من رسائل البريد الإلكتروني ، لكننا وصلنا إلى هناك". ومع ذلك ، فإنها تشعر بالقلق من أن العقبات التي يواجهها فريقها في Broad سوف تبطئ المعامل الأخرى. ستكون جهود الاختبار حاسمة بشكل خاص حيث تخفف الدولة من إجراءات التباعد الاجتماعي ، كما يضيف باتريك أيسكو ، عالم الأوبئة المشارك في الاختبار في Chan Zuckerberg Biohub. يقول: "نحن بحاجة إلى إطار عمل وطني للدول لاتخاذ قرارات بشأن الاختبار". في رسالة إلى البيت الأبيض حصلت عليها مجلة Nature ، ذكر العلماء الاختناقات التي يواجهونها ، إلى جانب خطة لمساعدة المدن والبلدات في جميع أنحاء الولايات المتحدة في الحصول على الاختبارات التي يحتاجونها.

تأتي المكالمة من اتجاهات أخرى أيضًا. في 8 أبريل ، أرسل ثلاثة من قادة الكونجرس في واشنطن العاصمة رسالة إلى أليكس عازار ، سكرتير وزارة الصحة والخدمات الإنسانية ، لوضع استراتيجية وطنية للاختبار. وكتبوا: "لا يزال أعضاء الكونجرس قلقين للغاية بشأن التقارير المتعلقة باختبار النقص واختبار توافر الإمدادات". "لقد حان الوقت الذي تستخدم فيه الإدارة كل أداة في قوتها لإصلاح هذه المشاكل".

اقرأ المزيد عن تفشي فيروس كورونا هنا.